به طور کلی در فصلنامه «پژوهشنامه حقوق اسلامی» از دو دسته مقالات «پژوهشی» استقبال می‌شود:

دستۀ نخست، متمرکز بر شیوه مبنایی و نظری و شیوۀ تعامل حقوق، فقه، فلسفه با حقوق است. این دست مقالات با تأکید بر نظریه‌های مبنایی حقوق اسلامی سعی در واکاوی و ارائۀ نظریۀ جدید در ادبیات حقوقی کشور دارد. دستۀ دیگر مقالات، مقالاتی است که سعی می‌کند مشکلات و مسائل حقوقی را در عرصۀ عمل، با نگاه مبتنی بر نیازهای نظام جمهوری اسلامی حل کند. به‌عبارت دیگر، در دستۀ دوم مقالات سعی در ارائۀ راهکاری‌هایی مناسب جهت رفع چالش‌های حقوقی است که نظام جمهوری اسلامی به سبب ماهیت اسلامی آن دست به گریبان است.